El Departamento de Fiscalía está liderado por la Dra. Paulette Arrieta Hernández, fiscala de Junta Directiva, y por dos fiscales auxiliares: Dra. Mariana Chavarría Mena y la Dra. Graciela Sánchez Obando. Además, cuenta con el apoyo administrativo de la Sra. Angie Gutiérrez Abarca.
Este departamento se encarga de velar por el fiel cumplimiento de las leyes y los reglamentos que rigen el ejercicio profesional de la odontología en nuestro país.
Es el departamento responsable de las nuevas incorporaciones y de recibir denuncias por posibles faltas al Código de Ética cometidas por los colegiados. La Fiscalía es el enlace del colegio con las principales instituciones gubernamentales y privadas del país.